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Verificato da me personalmente

Dal al sono stati raccolti campioni di suolo annuali da queste tre stazioni e le comunità microbiche sono state analizzate sequenziando gli ampliconi del gene RNA ribosomiale microbico 16S utilizzando la tecnologia Illumina MiSeq. I nostri risultati hanno rivelato un modello nettamente differenziale di comunità microbiche nei trapianti sia verso nord che verso sud, insieme a un aumento della ricchezza microbica con il raffreddamento del clima e una corrispondente diminuzione con il riscaldamento del clima.

Il tasso di successione microbica è stato stimato dalla pendenza valore w della regressione lineare di una somiglianza di comunità microbica trasformata nel registro con il tempo relazione tempo-decadimento.

Il riscaldamento climatico porta a un più rapido tasso di successione delle comunità microbiche, nonché a una minore ricchezza di specie e cambiamenti nella composizione rispetto al raffreddamento in situ e al clima, che possono essere correlati agli alti tassi metabolici e all'intensa competizione a temperature più elevate.

Questo studio fornisce nuove informazioni sugli impatti dei cambiamenti climatici sul ridimensionamento temporale fondamentale delle comunità microbiche del suolo e della biodiversità filogenetica microbica. Dato il ruolo fondamentale delle comunità microbiche nel ciclo biogeochimico, le loro risposte ai cambiamenti climatici possono portare a ripercussioni sulla struttura degli ecosistemi e feedback sul sistema climatico Wardle et al.

Precedenti studi hanno indicato che la temperatura è un fattore determinante per la composizione microbica del suolo Castro et al.

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Tuttavia, mancano ancora informazioni sulla relazione tra successione della comunità microbica e molteplici cambiamenti ambientali derivanti dai cambiamenti climatici. Il trapianto di suoli tra diverse regioni geoclimatiche offre un potente approccio per testare le risposte delle comunità microbiche a scenari di cambiamento climatico che alterano simultaneamente molteplici fattori Bottomley et al.

In generale, si prevede un aumento della temperatura e delle precipitazioni nel trapianto verso sud riscaldamento climaticomentre una riduzione di questi parametri è prevista nel trapianto verso nord raffreddamento climatico alle latitudini settentrionali lungo le zone costiere. Pertanto, siamo stati in grado di analizzare gli effetti climatici sulla sensibilità delle comunità microbiche.

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È stato segnalato l'effetto climatico sulle comunità microbiche simulato dal trapianto di suolo, ma è ancora in discussione. Waldrop e Firestone hanno scoperto che la biomassa microbica, la composizione, le attività enzimatiche e la respirazione diminuivano quando i terreni sotto le tettoie di quercia venivano trapiantati in un ambiente di prati aperti con temperatura massima più elevata e contenuto di acqua del suolo inferiore.

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Bottomley et al. Allo stesso modo, i nostri studi precedenti hanno indicato che il trapianto di suolo nero in regioni più calde Zhao et al. Al contrario, Lazzaro et al.

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I risultati contrastanti richiedono ulteriori studi per esaminare gli effetti del trapianto sulla struttura della comunità microbica e sui meccanismi coinvolti. Il turnover temporale delle specie è definito come il numero di specie eliminate e sostituite per unità di tempo MacArthur e Wilson, ; Magurran, ; Hatosy et al. I cambiamenti nel numero di specie possono essere descritti usando la relazione tempo-decadimento, che è un modello comune per descrivere i cambiamenti nella somiglianza della comunità nel tempo Nekola e White, Le percentuali di turnover temporale variano in relazione ai tipi di ecosistemi Korhonen et al.

Il turnover temporale è stato ben documentato nelle comunità vegetali e animali, ma le informazioni sul turnover temporale microbico sono insufficienti. Solo pochi studi, basati principalmente su sistemi ingegnerizzati per periodi relativamente brevi da minuti a mesihanno utilizzato la relazione tempo-decadimento per verificare se le previsioni teoriche dell'assemblaggio e della dinamica della comunità siano applicabili alle comunità microbiche Oliver et al.

Di recente, Alison perdita di peso huntsville al et al. La variazione del turnover temporale microbico del suolo con i cambiamenti climatici e i meccanismi sottostanti rimangono sconosciuti. Per comprendere la stabilità della comunità microbica del suolo e il turnover temporale in risposta al riscaldamento e al raffreddamento del clima, è stato condotto un esperimento di trapianto di suolo in tre stazioni agricole di vecchia data situate su grandi transiti dalla stazione Fengqiu nella Cina centrale zona alison perdita di peso huntsville al calda alla stazione Yingtan nella Cina meridionale zona subtropicale media e la stazione di Hailun nella Cina settentrionale zona temperata fredda.

Dal al sono stati raccolti annualmente campioni di suolo dalle tre stazioni per testare le seguenti ipotesi: i i trapianti di suolo altereranno significativamente il turnover temporale microbico del suolo e il riscaldamento climatico porterà a tassi di successione microbica più elevati; ii diversi gruppi microbici mostreranno sensibilità differenziali alle perturbazioni del cambiamento di temperatura; iii la temperatura è il fattore più importante che influenza il ridimensionamento temporale fondamentale della biodiversità microbica.

I nostri risultati hanno rivelato un modello nettamente diverso di comunità microbiche nei trapianti verso nord e verso sud.

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Questi blocchi erano circondati da muri di mattoni di 20 cm e coperti di sabbia per isolare ciascuno dall'ambiente circostante. I terreni del sito centrale di Fengqiu, classificato come suolo di Cambisol, sono stati trasportati verso nord verso il sito di Hailun e verso sud verso il sito di Yingtan.

Il terreno è stato scavato in cinque strati profondi da 0, 2 m, con ogni strato sufficientemente miscelato e quindi riconfezionato in sequenza per mantenere la stratificazione del suolo.

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In ogni sito sono stati istituiti blocchi di terreno triplicati con il raccolto del mais. Il fertilizzante basale è stato applicato prima della semina metà dell'azoto, tutto il fosforo e tutto il potassio. La seconda metà del fertilizzante azotato è stata applicata come medicazione superiore nella grande fase di tromba della crescita del mais.

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Non è stata applicata l'irrigazione. Il mais veniva seminato e raccolto una volta all'anno. I campioni di terreno con alison perdita di peso huntsville al raccolto da questi tre siti sono stati designati alison perdita di peso huntsville al in situ sito originale di Fengqiua nord verso il sito di Hailun e a sud verso il sito di Yingtan.

Questo esperimento appartiene a un progetto integrato The Soil Reciprocal Transplant Experiment, SRTEche funge da piattaforma per una serie di studi che valutano il clima e gli effetti del ritaglio sulla diversità microbica del suolo e la sua funzione agro-ecosistemica Sun et al. Campioni di terreno triplicati da ciascuna stazione, un campione per ogni blocco, sono stati raccolti ogni anno da agosto a settembre dal al Inoltre, nel sono stati raccolti campioni del terreno originale trasportato in ciascun sito.

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Dieci nuclei di terreno katrina perdita di peso stati composti dal suolo di superficie 0—20 cm all'interno di ciascun blocco e sigillato in un involucro di politene, quindi conservato su ghiaccio e trasportato in laboratorio.

Qualsiasi materiale vegetale vivente visibile ad esempio radici è stato rimosso manualmente dal terreno composito in laboratorio. Il fosforo totale e il fosforo disponibili sono stati estratti rispettivamente da carbonato di sodio e bicarbonato di sodio; entrambi sono stati determinati con il metodo del blu di molibdeno Olsen et al.

Il potassio totale e il potassio disponibile sono stati determinati mediante fotometria a fiamma dopo l'estrazione con idrossido di sodio e acetato di ammonio, rispettivamente Kanehiro e Sherman, La materia organica del suolo SOM è stata misurata con il metodo di ossidazione del bicromato di potassio Allison, La conduttività elettrica del suolo è stata determinata con un conduttimetro del suolo.

La capacità di scambio cationico CEC è stata misurata in una soluzione di acetato di ammonio a pH 7 Chapman, Le caratteristiche climatiche, tra cui la temperatura media annuale, le precipitazioni e l'umidità relativa sono state ottenute dal database di osservazione meteorologica delle stazioni sperimentali. La biomassa fuori terra e il peso del grano del mais sono stati misurati immediatamente dopo il raccolto.

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Analisi di sequenziamento illumina di ampliconi del gene dell'rRNA 16S Il DNA genomico microbico è stato estratto da 5 g di terreno ben miscelato per ciascun campione combinando macinazione a congelamento e dodecil solfato di sodio per la lisi cellulare e purificato mediante elettroforesi su gel di agarosio, seguito da estrazione fenolo-cloroformio-butanolo come precedentemente descritto Zhou et al. I primer forward e reverse sono perdita di peso personalizzata dr jason cost etichettati con sequenze di adattatori, pad e linker.

Ogni sequenza di codici a barre 12 mer è stata aggiunta al primer inverso per raggruppare più campioni in una sequenza di sequenziamento MiSep. Le reazioni triplicate di PCR per ciascuna preparazione del campione sono state combinate e quantificate con PicoGreen.

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Da ciascun campione, ng del prodotto PCR sono stati raccolti e raggruppati con altri campioni per una sequenza di sequenziamento.

Dopo aver assegnato ciascuna sequenza al suo campione in base al suo codice a barre, consentendo fino a due disallineamenti, sono state ottenute un totale di 9 48 letture da entrambe le estremità come una sequenza partizionata per il totale 63 campioni. Per aumentare la riproducibilità Zhou et al. Queste sequenze sono state quindi ritagliate usando Btrim con una soglia di punteggi di qualità superiore a 20 su una finestra di 5 bp e una lunghezza minima di bp Kong, Dopo aver rimosso le sequenze con basi ambigue cioè Nle sequenze con lunghezze comprese tra e bp sono state sottoposte alla rimozione della chimera da parte di U-Chime Edgar et al.

Le OTU finali sono state generate in base ai risultati alison perdita di peso huntsville al clustering e le annotazioni tassonomiche sono state assegnate a ciascuna sequenza rappresentativa di OTU dal classificatore RDP 16S Wang et al.

I singletoni sono stati rimossi per le analisi a valle.

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I campioni sono stati rarefatti a 10, sequenze per campione. Relazione tempo-decadimento e altre analisi statistiche Abbiamo usato la regressione lineare per esaminare la relazione tra la distanza temporale tra i campioni e la somiglianza nella composizione microbica.

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La distanza di Bray-Curtis è stata utilizzata come metrica basata su taxon delle differenze nella composizione della comunità. È stato eseguito un test t di un campione tra la pendenza originale e una media delle pendenze bootstrap mediante accoppiamento casuale dell'insieme originale permutato volte per testare il significato dei valori w Horner-Devine et al.

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Il confronto di significatività dei valori di w tra diverse stime è stato ottenuto anche mediante bootstrap volteseguito da un test t a coppie. Come posso aumentare la perdita di peso modelli di distribuzione microbica dei trapianti verso nord e verso sud sono stati determinati dal ridimensionamento multidimensionale non metrico NMDS Kruskal, Un test di dissomiglianza della composizione della comunità microbica è stato eseguito usando test statistici multivariati non parametrici e analisi di somiglianze Clarke, I test di Mantel e parziale di Mantel sono stati utilizzati per calcolare le correlazioni tra i fattori ambientali e la comunità microbica del suolo Legendre e Legendre, BIO-ENV è un algoritmo che identifica il miglior sottoinsieme di variabili ambientali in modo tale che le distanze euclidee di variabili ambientali scalate abbiano la massima rango correlazione con le differenze della comunità Clarke e Ainsworth, Anche l'analisi della corrispondenza canonica CCA e CCA parziale Legendre e Legendre, sono state utilizzate per identificare l'effetto delle variabili geochimiche del suolo, delle piante e del clima sulla composizione della comunità microbica.

Tutte le analisi di cui sopra sono state eseguite in R versione 3. È stato costruito un albero filogenetico circolare a massima probabilità basato sulle sequenze rappresentative di ciascuna OTU, come determinato da Uclust.

Le precipitazioni medie annue erano simili tra Fengqiu e Hailun, ma due volte più elevate a Yingtan Figura supplementare S1b.

Tuttavia, la produzione di resa peso delle sementi è diminuita significativamente sia nei trapianti verso nord che verso sud rispetto a quelli in situ Figura supplementare S2bindicando in tal modo l'impatto significativo del raffreddamento climatico o del riscaldamento sulle rese delle colture, in particolare per la bassa produttività indotta dal riscaldamento.

Schema generale di successione microbica Le comunità microbiche del suolo nelle alison perdita di peso huntsville al località sono state analizzate ogni anno dal al sequenziando gli ampliconi microbici del gene rRNA 16S con la tecnologia Illumina MiSeq. Un ulteriore confronto della composizione tassonomica microbica a livello di phyl ha mostrato che i proteobatteri erano il phylum dominante presente in tutti e tre i siti, seguito dagli Acidobacteria Figura complementare S4.

Il modello generale di successione microbica nell'esperimento di trapianto di suolo a lungo termine è visualizzato sulle prime due coordinate dell'ordinazione di ridimensionamento multidimensionale non metrica basata sulla dissomiglianza di Bray — Curtis Figura 1a. Come previsto, lo stretto raggruppamento di campioni nel ha indicato origini simili per i suoli che contenevano una composizione microbica simile.

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Un modello chiaramente diverso è stato osservato tra i campioni nei tre siti a partire dal